Shinji comienza a relacionarse mejor con sus amigos y sus compañeros en medio de las batallas contra los ángeles y, gracias a Kaji, recuerda detalles importantes acerca de su pasado. Por su parte, Misato descubre secretos por demás estremecedores escondidos en las entrañas de Nerv. Poco después, finalmente es revelada de identidad del cuarto niño que pilotará un Eva para enfrentar a los ángeles. El equipo de Nerv se dispone a hacer una prueba de pilotaje, pero el resultado es tan terrible como imprevisto.