Kyoosuke Koosaka nunca ha tenido una buena relación con su hermana menor, Kirino, ya que tienen personalidades muy diferentes; él es un joven promedio, mientras que Kirino es un modelo a seguir, inteligente, hermosa y popular. Un día, Kyoosuke encuentra un DVD de anime en su casa, pero nunca imaginó que pertenecería a Kirino. Al descubrir esto, su hermana le pide que guarde el secreto, ya que, si su círculo social llegara a enterarse de que es una “otaku”, su vida como la conoce terminaría. Este incidente hará que estos hermanos se acerquen cada vez más.